snRNA-sequencing, scRNA-sequencing 란?

snRNA-sequencing과 scRNA-sequencing 모두 유전자 발현(Gene expression)을 프로파일리하기 위한 방법들입니다. 자세한 내용은 더 알아보도록 하겠습니다. 

 

 

단일 세포 분석(Single-cell analysis)

: 세포 한 개 단위에서 각 세포의 생물학적 특성을 분석해주는 차세대 분석 기법이다. 단일 세포 분석을 통해 얻을 수 있는 방대한 양의 정보는 

 

 

snRNAseq (Single nucleus RNA Sequencing)

: 하나의 세포에서 수천 개의 유전자를 동시에 측정할 수 있는 단일 세포 시퀀싱 검사를 의미 

 

-> snRNA 시퀀싱 방법은 보존된 조직이나 분리하기 어려운 세포와 같은 세포에서 유전자 발현을 프로파일링하기 위한 방법입니다. 이 방법은 단일 세포 RNA 시퀀싱(scRNA-seq)의 대안으로, 세포 대신 세포핵을 분석합니다

 

장점

. 불필요한 유전자 발현을 최소화

. 새로운 세포 유형의 발견 가능

 

 

snRNA-seq 은 다양한 어려운 분리 조직 및 세포 유형, 예를 들어 신경세포, 신장, 심장, 간 지방세포, 근육 섬유 등에 적용되었습니다. 이 방법은 대부분의 조직에서 부착된 세포 유형을 회복하는데 더 강력하며, scRNA-seq은 면역 세포 유형에 편향되어 있습니다.

 

 

Gene Expression

유전자에서 정보를 가져와 기능적인 유전자 제품을 합성하는 과정입니다. 이 과정을 통해 세포는 단백질이나 기능적인 비코딩 RNA를 생산할 수 있으며, 이는 최종적으로 생물체의 표현형에 영향을 미칩니다. 유전자 발현은 모든 생물체에서 일어나며, 유전체에서 관찰할 수 있는 가장 기본적인 수준에서 유전형이 표현형으로 전환되는 과정입니다. 

 

단계

. 전사 (transcription): DNA에서 RNA분자로 정보를 전달하는 과정입니다. 이 과정은 유전자가 "켜짐/꺼짐 스위치"로 작용하여 세포 내에서 RNA 분자와 단백질이 언제, 어디서 만들어지는지를 조절합니다.

. RNA 스플라이싱(RNA splicing): 전사된 RNA 분자에서 인트론(비코딩 서열)을 제거하고 엑손(코딩 서열)을 연결하는 과정입니다.

. 번역(trnaslation): 전사된 RNA 분자를 아미노산으로 번역하여 단백질을 합성하는 과정입니다.

. 단백질의 후처리(post-translational modification): 합성된 단백질에 화학적 변형을 가하는 과정으로, 단백질의 기능을 조절합니다.

 

유전자 발현은 세포의 기능과 발달, 특정 대사 경로를 촉매화하는 단백질의 합성을 통해 생물체의 구조와 기능을 결정하는 중요한 과정입니다. 또한 유전자 발현은 세포의 상태와 환경 조건에 따라 조절될 수 있으며, 이는 세포가 자신의 기능을 조절하는 데 중요한 역할을 합니다.